Hola
Acabo de leer tu pregunta. Esto es lo que pone en la página oficial de sony

* / Ayuda y Asistencia técnica/ PSP/ Guías/ Sobre la actualización (v. 3.90)

"No instales actualizaciones que no sean las proporcionadas oficialmente por Sony Computer Entertainment a través de la red o en disco, ni por métodos distintos a los descritos en la documentación del producto o en este website. Si se instala una actualización mediante datos de otras fuentes, con métodos distintos o con un sistema PSP que haya sido modificado o alterado, es posible que el sistema PSP no funcione correctamente y no se pueda instalar la actualización oficial. Cualquiera de las acciones mencionadas anteriormente anulará la garantía del sistema PSP y repercutirá en tus derechos a la prestación de servicios de garantía y reparación por parte de Sony Computer Entertainment."

Con eso queda bastante claro que la garantía seguiría igual. Ponerlo para luego no cumplirlo sería muy descarado por su parte.

Espero que te resuelva la duda aunque con el tiempo que ha pasado desde que preguntaste, a lo mejor ya lo has visto tu