Los modos de juego son cinco. Para empezar tendremos el clásico Deathmatch o “todos contra todos” como siempre es el más simple y divertido. Team Deathmatch “lucha en equipo”, los soldados se dividirán por colores, rojo y azul, y se deberán eliminar mutuamente. Capture mission consiste en un “capturar la bandera”, sólo que en este caso la bandera es una rana Karoten, y para ganar habrá que mantenerla un mínimo de tiempo en nuestro poder sin que nos la robe el equipo contrario. En Rescue mission un equipo se encargará de rescatar a los rehenes al más puro estilo de Counter-Strike, mientras que el otro equipo deberá evitar que los liberen de su secuestro. Y para finalizar, la opción más interesante es Sneaking mission, donde uno tomará el papel del espía con una misión que llevar a cabo, mientras que el resto deberá encontrarlo y tratar de impedirlo.

Estos cinco modos de juego abren un gran abanico de posibilidades gracias al completo manejo de los personajes (con la obvia eliminación del CQC) y la inclusión de la nueva cámara en tercera persona.

Dispondremos de un amplio arsenal de pistolas, fusiles, rifles de francotirador o granadas entre otras, que podremos elegir al principio de cada ronda, así como de objetos variados como las famosas revistas de muchachas ligeras de ropa que nos distraerán sin quererlo unos segundos.

El juego multijugador soporta hasta 8 jugadores simultáneos. Hay tres tipos de equipos que son la unidad Ocelot, los soldados GRU o la KGB. También incluye un gran número de escenarios, algunos tomados del mismo Snake Eater y otros totalmente inéditos, completando así este juego que bien podría ser vendido aparte.

En este mismo DVD se han incluido todas las misiones de Serpiente contra mono, y también algunas pantallas nuevas en las que enfrentar de nuevo a Snake contra los simpáticos monitos de Ape escape, otro estupendo minijuego.