Modo Shadow:
Cuando completemos cualquiera de las misiones del juego, podremos jugarlas de nuevo en el "Modo Shadow". Para ello, pulsa Start en la pantalla de selección de misión del modo Historia. Este modo es una versión más difícil de las misiones que hemos completado, con menos artículos y con más enemigos en diferentes configuraciones.

Artículos extra:
· Ninjato indestructible (Espada): Obtén el 100% de los trozos del mapa en la Historia Normal.
· Máscara y traje Onikage: Obtén el 100% de los trozos del mapa en el modo Shadow.
· Antiguas técnicas Hissatsu: Completa 30 misiones.
· Vestuario Tenchu clásico: Completa el modo Historia en cualquier nivel de dificultad.
· Izayoi (Espada indestructible de Rikimaru): Obtén todos los pedazos del mapa de las misiones 1-5 y 10.
· Onibi (Espada indestructible de Ayame): Obtén todos los pedazos del mapa de las misiones 6-9.
· Máscar del diablo: Consigue las 20 piezas de la máscara en el modo Shadow.
· Ninja Tabi '08: Completa el modo Historia.

Misiones extra:
· 4 Misiones extra: Alcanza el rango S en las diferentes misiones del modo Historia.
· 3 Misiones extra: Alcanza el rango A en las diferentes misiones del modo Historia.
· 2 Misiones extra: Alcanza el rango B en las diferentes misiones del modo Historia.

Galerías de música y sonido:
· Galería de música: Completa 20 misiones en las que alcances el rango S.
· Galería de sonido: Completa 20 misiones en las que alcances el rango S.

Galería de Arte Conceptual:
Completa 10 misiones.

Memories (Video Galería):
Completa 40 misiones.

Arroz de colores:
Completa 50 misiones en las que alcances el rango S, y se añadirá a tu inventario.

Speed Socks:
Completa el juego en Normal. Cuando los uses no podrás alcanzar ningún rango.