Similar al Mission Mode de Mario Kart DS. No llegó a la versión final.
El Youtuber MrBean35000vr, especializado en Mario Kart, ha compartido un peculiar descubrimiento sobre Mario Kart Wii: parece que Nintendo decidió no lanzar un modo Misión similar al de Mario Kart DS a pesar de haber adelantado mucho trabajo, escenarios y enemigos. A pesar de dejarlo fuera, dejó todo el trabajo dentro de la versión definitiva sin dar acceso posible a los jugadores.
Sin embargo, el Youtuber ha logrado crear un acceso al contenido, pudiendo demostrar su existencia y mostrando algunas de las pruebas en su canal. Durante la promoción del juego en su día no se habló ni se especificó nada sobre un posible Mission Mode para Mario Kart Wii, de ahí que la sorpresa haya sido mayúscula entre los aficionados. El modo Misión invitaba al jugador a competir en una serie de pruebas a bordo de un kart.