El título contará con un sistema de "cambio de líder" similar al del clásico Marvel Vs Capcom.
Las páginas de la revista japonesa V-Jump confirman la presencia de Hanabi Hyuga como una de las nuevas luchadoras que harán acto de presencia en Naruto Shippuden: Ultimate Ninja Storm 4. Hermana de Hinata, esta ninja mostrará en acción la apariencia que lucirá en la película The Last: Naruto the Movie.
A todo esto, el magazine nipón también ha dado a conocer el nuevo sistema de "cambio de líder" que estrenará el juego y que, en pocas palabras, nos permitirá cambiar a nuestro personaje principal por uno de los luchadores de apoyo con total libertad. Algo muy del estilo de clásicos del género como Marvel Vs Capcom.