Ausencia total de cualquier tipo de multijugador.
como la de ponerse a la venta dotados únicamente de una experiencia para un solo jugador.
Assassin´s Creed o Bioshock son ejemplos de que no es necesario añadir el componente multijugador para crear un videojuego memorable, y parece que en Vivendi están convencidos de que Prototype está dotado de una fortaleza similar en términos de campaña.
Desde Radical Entertainment, sus creadores, se ha declarado que se ha decidido prescindir del multijugador de carácter cooperativo que en principio había previsto.
Las razones que se han aducido han sido lo robusto de la experiencia individual y la falta de tiempo para desarrollarlo debidamente si se querían cumplir los plazos de producción para el lanzamiento previsto en otoño de este mismo año.